人工合成者与内源蛋白之间有竞争，当五肽链存在时，内源蛋白的γ-羧基化的开始速度减少，内源蛋白存在时推迟五肽链γ-羧基化的时间。γ-羧基谷氨酸(γ-Cacbocyglutamic Acid, Gala)的蛋白质或肽名字形成后，与Gla相邻的羧基具有与钙及磷脂结合的特性。Gla蛋白质可以在他生成场所或输出到靶组织中发生作用。Gla蛋白分解的终产物为游离式的Gla及含Gla的肽链，在尿中排出。
正常人尿中排出量为44±11μmol/g肌酐，儿童排出较多，5岁时约为100μmol/g肌酐，以后排出量逐渐下降，至15岁时降到成人水平，使用抗凝剂者，尿中Gla水平仅为24μmol/g肌酐，凝血酶原时间比正常者升高2～3倍，Gla的总排出量25%，不受抗凝剂的影响，可代表骨中骨钙蛋白(osteocalcin)的转换。有些疾病Gla的排出也有变化。例如多数骨质疏松病人，尿中Gla的排出比正常人增加50%，相当于骨的转换率之3倍。皮肤炎与硬皮病患者尿中排出也增加。
凝血作用
血液凝固是从组织损伤和血小板破坏后引起的一系列的酶促链式反应。血液凝固过程中一些酶原(proenzyme) 的合成与维生素K2有关，亦即在他们的合成中需要谷氨酸γ-羧基化。这些酶原除因子Ⅱ、Ⅶ、Ⅸ及X外，还发现了蛋白C、S、M，Z。这四种新发现的蛋白，他们的1～40氨基酸排列顺序与凝血酶原同源。蛋白C干扰血液凝固，并促进血纤维蛋白的溶解，在体外活化的蛋白C可以使因子Ⅴ及Ⅷ灭活，蛋白S可以加强蛋白C的活力，他有10个Gla。
蛋白M可以促进凝血酶原转变为凝血酶。蛋白Z有13个Gla。对些蛋白了解得还很少，需要进一步的研究。凝血酶原的合成，先在肝细胞粗内质网膜上的形成新生成肽链，然后再进行一些谷氨酸的γ-羧基化和糖基化。在凝血酶原的NH2末端的7，8，15，17，20，21，26，30，332位置的谷氨酸γ-羧基化变成Gla。33位后的谷氨酸不转变为Gla。这种γ-羧基化的特殊选择并不是由氨基酸的排列顺序所致，而是由于蛋白前体在膜上的位置与构形所致。1分子的正常凝血酶原与10—12Ca2+相结合，未γ-羧基化者只能与一个分子Ca2+结合。
与骨基质中含Gla蛋白的关系
骨基质有几种含Gla的蛋白，主要为BGP(Bone Gla Protein, BGP)与Ca结合者叫做骨钙蛋白，在骨细胞内合成，分泌到血液或组织，然后到骨基质中，占骨中总蛋白垢1～2%，为非胶原蛋白的10～20%。骨钙蛋白出现在骨矿物化之前，骨密度增加，他也增加。他有2个钙结合点，钙离子为0.8mmol/L可以使其半饱和，其他二价正离子如镁、锶、钡也能与之结合，但钙离子结合能力强，他的作用在调节钙在骨基质中沉积，与羧磷灰石(hydroxy apatite)的核心起作用。
也有迹象说明BGP的合成为1, 25(OH)2D3所调节。BGP可能调节1, 25(OH)2D的破骨作用，使其作用缓慢。在一些骨的疾病中，血浆中BGP水平上升，这说明他可能促进骨的重建及钙的动员。怀孕早期如母亲服用维生素K2拮抗剂，其胎儿骨骼发生流血现象，这一现象说明，在胎儿生长过程中，需要维生素K2的骨骼系统发育比血流凝固系统要早一些，从母体将钙运输至胎儿这一过程对维生素K2拮抗剂敏感，可能干扰了胎盘中γ-羧基化蛋白的合成。
其他肾小管细胞有含Gla的蛋白质，为其总蛋白的0.2～0.7%，它是与膜结合的蛋白，也与钙离自结合。钙在肾小管细胞内的再吸收与之有关。其他组织如牙质、胎盘、睾丸、胰、脾、肺、乳腺等都含Gla蛋白质，功用不明。有些组织如肌肉、心脏及淋巴细胞中尚未发现。在有些疾病如肾结石(尤其是草酸钙及磷灰石结石)含有Gla的蛋白质、正常主动脉及脂肪条纹及纤维斑块中没有含Gla的蛋白质，而动脉硬化钙化斑块中含有Gla的蛋白质。
维生素K2是人体高活性的多功能明星分子，是骨和钙代谢的必需物质和关键控制因子。中老年人常常并发的骨质疏松与动脉钙化具有共同的致病机制，那就是由于维生素K2缺乏所导致的异常钙代谢。
维生素K2利用其高效谷氨酸残基的γ-羧化作用激活骨钙素(BGP)和基质γ-羧基谷氨酸蛋白(MGP)，其活化程度取决于体内维生素K2的水平。活化后的BGP具有将Ca2+与羟磷灰石特异性靶向结合特性，从而打通钙在骨骼定向沉积的高速公路，补足成骨短板。同时MGP对血管钙化具有强烈的抑制作用，可彻底清除血管壁钙斑，恢复血管弹性。
