儿童鼻窦炎在药物上可以选择抗菌性药物、抗组胺药物、抗炎治疗，另外局部可以用一些鼻腔冲洗剂。儿童鼻窦炎经过恰当治疗可以治愈，不需要手术治疗。
邵剑萍：治疗方面一个就是说，可以选择性的用一些抗菌的药物，有青霉素类的、头孢菌素类的，还有以及大环内酯类;第二个就是说，可以用一些抗炎治疗，局部可以用一些鼻用激素;第三个是选择性的用一些抗组胺药，对于有一些变态反应体质的儿童，可以用一些抗组胺的，鼻塞严重的，选择性使用一些鼻减充血剂，比如说羟甲左宁或者是塞洛左宁类的，但是使用时间要控制在七天以内，另外局部可以用一些鼻腔的冲洗，减轻炎症反应，后一点就是强调中医中药治疗，在这方面目前还没有循证医学的依据，另外儿童鼻窦炎，到目前为止，经过恰当的治疗是可以恢复的，不需要手术治疗。
