1、LK植物液
疗效尚可，但损伤大，易留疤痕及色素沉着，不过脚上扁平疣的患者可以采用该治疗方法。
2、注射激素转移因子
西医治疗扁平疣主要注射转移因子等激素来提高人体免役功能。由于这一种间接性治疗不是直接能杀灭扁平疣病毒，所以治好率也很低，特别是对一些年龄偏高的人。
3、采用激光铲除的方法
由于扁平疣病毒是在表皮下面，激光只能铲除表面扁平疣颗粒，而皮下病毒没有铲除，所以不可能起到根本的治疗作用，往往过了几个月扁平疣还会重新发出来。
4、口服药
由于从口服到内脏吸收到达皮肤，药力损耗大，不是直接杀灭病毒，所以效果并不理想，并且要长期连续服用几十天，一般人很难坚持。
5、冷冻治疗
相对于激光疗法要缓和得多，在扁平疣亦可选用，但应注意掌握时机。扁平疣在初发时，皮损较活跃，发展较快。疣体色浅褐、浅红或与肤色接近，可稍带光泽，显得很鲜活。这时如果采用冷冻治疗，容易刺激疣体增生，造成病损增多、扩大，反而加重病情。扁平疣时间较久者，疣体成熟、稳定，大小如黄豆或绿豆，颜色深褐至黑褐色，缺乏光泽，显得很晦暗。这时较适合冷冻治疗。
