在女性患者中，经常有月经紊乱，其主要表现为月经量少或闭经，月经周期延长、缩短或变得毫无规律，5%~1O%的性高潮和性激动反应增强，15%的有轻度减弱。主诉阳痿或闭经的为常见，虽然约有4%的男性患者可发生阳痿，但发生机理尚不清楚，可能与心脏疾患、肝脏损害、肌病等并发症有关。
一般只要控制好了甲亢引起的代谢紊乱，性功能改变就可以消除。甲亢病人的治疗主要有药物、同位素和手术三种，药物治疗是基础治疗，其他治疗也必需先用药物控制甲亢症状。约5O%的甲亢患者可用药物治愈，但必须坚持足量、系统、坚持三个原则，至少坚持服药一年半。不能因为症状消失，血中甲状腺激素水平恢复正常，就认为甲亢已治愈。
同位素治疗简单易行，只需服药一次，疗效肯定，适用于4O岁以上、中度甲亢和甲状腺肿大者。若病情较严重、开始即肿大明显、甲状腺在胸骨后或不愿坚持长期服药且不适于做同位素治疗者，则应考虑手术治疗。这三种治疗方法各有利弊，患者应根据个体情况，由医生选择，并遵照医生嘱咐进行治疗。
术疗
放射碘治疗和手术治疗 都属于破坏性治疗，甲亢不容易复发，治疗只需要一次。放射碘适合甲状腺中度肿大或甲亢复发的患者，医生根据患者甲状腺对放射碘治疗图册的摄取率计算每个患者需要的放射剂量。
放射碘对孕妇和哺乳妇女是绝对禁忌证。由于放射碘的作用有一个延迟作用，随着时间随诊，甲减发生率每年3%～5%。放射碘治疗不适合有甲状腺眼病的甲亢患者，因为治疗后眼病可能会加剧。
手术治疗适合那些甲状腺肿大显著，或高度怀疑甲状腺恶性肿瘤的，或甲状腺肿大有压迫气管引起呼吸困难者。手术前需要用药物将甲状腺功能控制在正常范围，术前还需要口服复方碘溶液做术前准备。
药疗
西药
抗甲状腺药物治疗适应范围广，无论大人小孩，男性还是女性，轻症或者重症甲亢，首次发病还是甲亢复发，孕妇或哺乳女性甲亢都可以用药物治疗。
抗甲状腺药物有两种——咪唑类和硫氧嘧啶类，代表药物分别为甲巯咪唑(又称“他巴唑”)和丙基硫氧嘧啶(又称“丙嘧”)。
药物治疗适合甲亢孕妇、儿童、甲状腺轻度肿大的患者，治疗一般需要1～2年，治疗中需要根据甲状腺功能情况增减药物剂量。
药物治疗有一些副作用，包括粒细胞减少、药物过敏、肝功能受损、关节疼痛和血管炎，药物治疗初期需要严密监测药物的副作用，尤其是粒细胞缺乏，需要告诫患者一旦出现发热和/或咽痛，需要立即检查粒细胞以便明确是否出现粒细胞缺乏，一旦出现。立即停药急诊。药物治疗另一个缺点是停药后复发率高，大约在50%左右。
中成药
治疗甲亢的中成药较多，是临床医生从不同角度对本病治疗的经验总结。
