常呈现间断性腹部隐痛、腹胀、腹痛、腹泻为本病主要表现。遇冷、进油腻之物或遇情绪波动、或劳累后尤着。大便次数增加，日行几次或数十余次，肛门下坠，大便不爽。
慢性肠炎急性发作时，可见高热、腹部绞痛、恶心呕吐、大便急迫如水或粘冻血便。
5.腹泻
该病出现的主要的症状就是腹泻了，一般还是反复发作或者持续得不到治愈。情况较轻时一般每天会出现两到五次，一般大便都是带有黏液和脓血。
二、慢性肠炎的并发症
1.肠穿孔
肠穿孔多为中毒性肠扩张的并发症，也可出现严重型，多发生于左半结肠，皮质激素的应用被认为是肠穿孔的一个危险因素。
2.中毒性肠扩张
中毒性肠扩张临床表现为病情迅速恶化，中毒症状明显，伴有腹泻、腹部压痛和反跳痛，肠鸣音减弱或消失，白细胞数增多，易并发肠穿孔。
3.肠狭窄
肠狭窄多发生在病变广泛、病程持续长达5-25年以上的病例，其部位多见于左半结肠，乙状结肠或直肠，临床上一般无症状，严重时可引起肠阻塞，在本病出现肠狭窄时，要警惕肿瘤，鉴别良性恶性。
4.结肠癌
慢性肠炎大约有5%病例发生癌变，多见于病变累及全结肠，幼年起病和病史超过10年者。
