口腔不可能成为一个无菌的环境，也不能把所有的细菌都消灭。因为消灭细菌之后，又会有真菌袭来，造成更严重的、很难控制的后果。因此我们必须坚持不懈地与牙菌斑作斗争，防止牙菌斑发展壮大，甚至最终钙化，形成牙石。
一、刷牙
刷牙是众所周知的口腔护理方法，也是清除牙菌斑最基本和最主要的方法。首先要坚持早晚刷牙，而晚上刷牙尤其重要。牙面上的食物残渣没有及时清除，为细菌提供了极其丰富的营养物质，细菌可以大量增殖，同时产生更多的有害物质，而睡眠中，唾液分泌减少，不能很好地中和、稀释这些有害物质，因而会对牙齿造成严重的危害。
1、关于牙刷、牙膏的选择：牙刷一般建议选用软毛牙刷，避免对牙齿或牙龈造成损伤，而近年来含药物的牙膏种类较多，主要功效有防龋、抑菌、止血、脱敏及减轻口臭等。但药物仅起辅助作用，主要靠机械清扫作用，正如洗衣服时，洗衣粉只起辅助作用，关键在于揉搓。
2、刷牙的方法：刷牙的方法有数十种之多，关键在于牙刷到位，面面俱到。现仅介绍最常用的水平颤动法(又称Bass法)。一般的方法刷牙后，在牙齿与牙齿之间常余留菌斑，需要用其他方法来补充，来清除残留的菌斑。根据牙缝的大小不同可以使用牙线、牙签或间隙刷。
二、牙与牙之间的清洁
1、牙线
牙线是最常推荐使用的清除牙与牙之间的菌斑的方法，效果很好，适用于大多数人。但对于牙龈退缩严重，且牙根面呈凹陷外形的人不适用，这类患者应用间隙刷清洁牙与牙之间。
2、牙签
对于牙龈乳头有退缩，牙间隙增大的情况下，可以用牙签来清洁牙与牙之间。应选用硬质木制或塑料的光滑无毛刺的牙签，将间隙两侧的牙面上的菌斑“刮”净。注意不要损伤牙龈。对于无牙龈乳头退缩的人，不适宜使用牙签。
使用牙签是否会使牙缝变大：牙缝变大是牙周炎组织破坏所致，并非牙签引起。牙龈因炎症而肿大，似乎充满牙间隙，在治疗后或者使用牙签、清除菌斑后，牙龈乳头的炎症消退而表现为退缩，使牙缝“变大”。
3、间隙刷(牙缝刷)
牙与牙之间有间隙，牙齿邻面外形不规则或牙根面为凹面时，清除菌斑的最佳方法是间隙刷，又叫牙缝刷。选用直径适宜的间隙刷，将刷头顺牙龈乳头的方向伸入到牙间隙处，做前后移动，将菌斑刷除。一般在每晚睡前刷牙后使用间隙刷即可。
4、其他
其他工具如家用冲洗器，可产生一定压力的水流，用于日常的口腔冲洗，有利于清除牙刷等措施不易到达的部位。家用冲洗器的应用不能替代刷牙，但可作为刷牙的补充手段。