一、自然流产的诊断
1.检查男方精液的情况
精子是新生命的使者，如果精子活动力差，畸形率高，或精液量少都可能影响精子与卵子结合;有缺陷的精子即使能和卵子结合，也往往有始无终，这种流产多发生在妊娠的头3个月内。
2.检查女方的排卵和黄体期情况
这可以从基础体温测量表上看出一些问题。如果排卵后基础体温爬升慢，超过36.7℃的天数不足10天，就提示有卵巢功能不全。即分泌的孕激素量较少而导致子宫内膜环境不适合孕卵种植和发育，就象贫瘠的土壤缺少肥料，幼苗容易枯萎一样，胚胎缺乏营养也易枯萎流产。
3.检查女方子宫和子宫颈内口的情况
子宫是培育胎儿成长的温床，如果子宫狭小或有畸形，如双角子宫、子宫纵隔以及生有突向子宫腔的子宫肌瘤，都会限制宫腔扩张，影响胎儿发育而致流产。如果子宫颈内口松弛，当胎儿发育到3～4个月以后，由于胎囊内羊水向宫颈口方向增加压力和重力，往往使松弛的宫颈内口支托不住，很容易突然扩张使胎儿流出。
4.对女方的健康情况作全面的检查
如在怀孕期间患急性感染性疾病(急性肝炎、流行性感冒、肺炎等)，细菌毒素或病毒可通过胎盘进入胎儿血液中，使胎儿中毒感染而死亡;孕妇长时间发高烧，也可刺激子宫收缩将胎儿排出。此外，妇女患有较严重的慢性病，如再生障碍性贫血、红斑狼疮、慢性肝炎、甲状腺功能亢进等，也可使内分泌系统紊乱，导致胎盘缺血缺氧而引起胎儿流产。
5.检查流产胚胎染色体情况
国外科研综合报道了3020例自然流产物细胞染色体分析资料，在妊娠2～3个月的流产物中，染色体异常的发生率高达60%;在妊 娠4个月的流产物中近52%;而在妊娠6个月的流产物中，染色体异常有7%。如果父母双方有一方查出染色体不正常，就不应怀孕或及时终止妊娠。因为即使胎儿能避免流产而发育到足月，大多数仍可能成为畸形儿或先天愚型。
二、自然流产的检查项目
1.B超检查
对疑为先兆流产者，根据妊娠囊的形态，有无胎心搏动，确定胚胎或胎儿是否存活，有助于正确进行指导治疗。
2.妊娠试验
临床多采用试纸测试法，对诊断妊娠有所帮助。
3.孕激素测定
测定血孕酮水平，可协助判断。
三、自然流产与其它流产的鉴别诊断
应与先兆流产、难免流产、不全流产、完全流产加以鉴别诊断。