血清学和影像学的不断发展为亚临床肝癌的早期诊断提供了各种方法，临床上把血清学诊断称为“定性诊断”，影像学诊断称为“定位诊断”，穿刺活检或脱落细胞检查称为“病理诊断”这些方法的综合应用可提高诊断的正确率。
1、B超 可显示大于1cm的肿瘤、诊断正确率为90%，可显示肿瘤大小，部位形态、数量、肝胆管、门静脉、脾脏、腹腔淋巴结等，同时对有无肝硬化、脾大腹水也可做出诊断。
2、CT 对肝癌的诊断准确率为93%，最小分辨显示为1.5cm，其优点是可直接观察肿瘤的大小、位置和肝静脉门静脉的关系，并可诊断门静脉或肝静脉有无癌栓。
3、血管造影 肝动脉造影可了解病变的血运情况以判断手术的可能性及指征。可显示1.5cm左右的肿瘤，是目前影像学诊断方法中，分辨力最高的一种，同时对鉴别肝血管瘤有重要的意义，在明确诊断的同时，还可了解肝动脉有无变异现象，对肝切除手术有很重要的帮助，如果为中晚期肝癌，不能手术治疗时，可给以栓塞和(或)化疗。
4、MRI和CT相比 基本一致，但对一些难以鉴别的肝肿块有帮助，T1、T2图像能比较明确地分辨肝癌、肝血管瘤、肝脓肿、囊肿等。
5、放射性核素扫描 对难以和血管瘤相鉴别的病人可运用血流扫描加以鉴别，因放射扫描的分辨力低，一般很少用来做肝癌的诊断方法。
6、腹腔镜 在难以确诊的病人可考虑用腹腔镜检查，直接观察肝脏、肝表面肿物及腹腔内的情况。
7、X线检查 X线透视下可见右膈升高、运动受限或限局性隆起，30%病例在X线平片中可见肿瘤内有钙化影，约10%病例诊断时有肺转移瘤。