一、患者对强直性脊柱炎治疗的恒心不够：
本身疾病就属于一种难治的疾病，倘若患者在治疗疾病期间，没有足够的信心与恒心，导致治疗的期限不足，或是往往采取一些方法见效都是比较慢的。但是患者不能坚持治疗，只要一段时间治疗不见效果，便对治疗丧失信心进而终止治疗。同时患者由于惧怕疼痛不进行有效的关节功能锻炼，导致关节很快强直，无法继续治疗。
二、对病因的研究不够明确：
这也是导致强直性脊柱炎治疗难的一大原因。因为该种疾病的发病原因不仅较繁多，而且还比较复杂，并且还具有明显的家族遗传倾向，强直性脊柱炎还有明显的种族遗传倾向，但是引起发病又与自身免疫功能在某个阶段出现低下有密切关系，同时与体内局部感染有关，还涉及环境因素。强直性脊柱炎是一个多脏器、多系统疾病，它涉及遗传学、免疫学、内科学、骨科学，为多学科疾病，所以治疗起来比较难。
三、治疗方法有限：
根据目前的医学水平，对强直性脊柱炎的治疗仅局限于骨科疾病的治疗上，虽说从疾病的表面来看，的确是因为一些关节的病变而造成患者关节强直的，但是实际上强直性脊柱炎又是一个地地道道的免疫学科疾病，累及多个脏器同时患病。手术抗原解决关节骨桥强直问题，但是解决不了术后骨桥继续形成问题，手术治疗往往以失败告终。免疫学治疗又难以解决肌腱末端炎症问题，骨桥继续形成病情难以控制。强直性脊柱炎的治疗难在哪儿呢。