血源疫苗是用乙型肝炎表面抗原携带者血清中的表面抗原做成的乙肝疫苗，故称血源性乙型肝炎表面抗原疫苗。于血源受限，在生产操作过程中对工人及环境不利，故国内外都停止了生产，用基因重组疫苗取代。
基因工程疫苗或称基因重组疫苗，是用基因重组技术把乙型肝炎病毒的表面抗原基因片段插入酵母或哺乳动物细胞的基因中，在体外培养增殖过程中组装或分泌出乙型肝炎表面抗原，然后把表面抗原收集起来，提纯之后做成乙型肝炎疫苗。因为在这种原材料中不含有乙型肝炎病毒，不造成对人及环境的污染，又能大规模的工业化培养酵母和细胞，所以原材料来源方便，疫苗价格也会随着生产的扩大而下降。
我国当前已能大规模生产酵母和中国仓鼠卵巢细胞分泌的乙型肝炎表面抗原重组疫苗，分别称酵母重组和CHO(中国仓鼠卵巢细胞)重组疫苗，免疫效果比同剂量的血源疫苗优良，并且十分安全。可以放心使用。
接种乙肝疫苗后，体内产生抗乙肝病毒表面抗原的抗体，简称表面抗体(抗-HBs)，可以有效防止乙肝病毒的感染，此外，丁型肝炎病毒(HDV)是缺陷型病毒，和乙肝病毒具有共同的表面抗原，只有在乙肝病毒复制的细胞内才能感染和复制，因此接种乙肝疫苗在预防乙肝病毒感染的同时也就预防了丁型肝炎病毒的感染，从而也就预防了丁型肝炎。