1.与苯丙酮酸尿症相鉴别
苯丙酮酸尿症是一组代谢疾病，智力损伤一般严重，出生时正常数月后即见患儿发育迟缓，易激惹，反应迟钝，发黄，肤色白嫩，蓝色虹膜，肌张力异常，共济失调，腱反射亢进，尿中有特殊鼠臭味，已有早期(新生儿期)诊断方法，应及早给予治疗。
2.与地方性克汀病(地方性呆小病)相鉴别
发生地方性甲状腺肿流行区，儿童除智力低下外，体材均矮小，且不匀称，反应迟钝，并可伴言语、听力障碍。体材下部短于上部量。体重低于同龄人，性发育亦迟缓等。宜早诊断早治疗。
3.与各种染色体疾患相鉴别
可以检查染色体，进行核型分析，有的有特殊体征，如21三体综合症的患儿，不论任何人种，都有共同特征：双眼距宽，两眼外角上吊，内眦赘皮，耳位低，鼻梁宽低，舌体宽厚，口张半张，舌伸向口外，舌面沟纹深而多，呈所谓“阴囊”舌。手掌厚而指短粗，末指短小，常向内弯曲。
4.与儿童孤独障碍相鉴别
精神发育迟滞的儿童中合并孤独障碍(Kanner)，孤独症患者突出表现更严重的社交发育障碍，和大量的社会行为偏移，其要获得语言和学业技能更为困难，其预后较单纯精神发育迟滞者差。此种患儿可以训练。
5.婴儿痴呆
3岁前智力各方面发育均属正常，有的孩童在某种感染大病之后，有的并无明显原因，在临床上以智力倒退为特点，最后成为痴呆，预后极差。