有很多女性都正在或者曾经受到过巧克力囊肿的折磨，可以说这是一种危害较大的疾病，而且疾病发作时的症状比较剧烈，患者往往会有剧烈疼痛的表现。那么如何治疗巧克力囊肿呢?有保守治疗和手术治疗两种方法。
1、保守治疗
保守治疗一般是指使用药物进行治疗，这样的药物也较多。通过药物作用让病人暂时停经3～6个月，卵巢内子宫内膜也不会出血，这样卵巢内的囊肿就可能缩小。绝经期间，痛经等症状可以完全消失，但是想让卵巢内的巧克力囊肿完全消失不太可能，停药后仍有复发的可能。
2、手术治疗
对于一些患者来说，采用手术治疗是最好的治疗方法，尤其是囊肿较大的患者。腹腔镜微创手术是一个可以根治此病的方法。巧克力囊肿患者,有痛经、性交痛、经血改变和不育等麻烦。因此及早治疗是很关键的。腹腔镜微创技术是一种无痛、无创、副作用小、恢复快的技术，也是目前最受卵巢巧克力囊肿所亲睐的一种技术。
由此可见，在治疗巧克力囊肿方面到底是采用药物治疗还是手术治疗要看患者的情况而定，一般药物治疗不太可能彻底根治，而只是起到一个缓解病情的作用，要想彻底治愈巧克力囊肿，最终一般还是要进行手术治疗。