如果两眼在远视的消减程度或近视的发展进度不同，就可引起屈光参差。先天因素者，出生时就有明显的两眼眼轴发育不平衡，两眼的屈光状态不相对称;另外，眼外伤、眼的手术也可造成屈光参差。
一、可以引起屈光参差的因素主要包括
1.发育因素
在眼的发育过程中，远视的度数在不断减轻，而近视的度数在不断发展，如果两眼的发展进度不同，就可能引起屈光参差。
2.双眼视功能的异常
屈光参差经常发生于斜视之后，主要是由于斜视影响或者说破坏了眼球正视化的过程，打断了双眼视功能的发育。
3.外伤和其他疾病亦可引起屈光参差
上睑下垂患者屈光参差的发病率大约为55%，其他如眼睑血管瘤，视网膜病变(玻璃体积血等)，核性白内障等。
4.手术因素
一些手术可造成人为的屈光参差，如人工晶体的植入，角膜移植，RK术等。
按照其发病病因可以进行如下分类：遗传性(hereditary)，包括先天性青光眼，先天性白内障和一些导致眼睑闭合的疾病，如先天性动眼神经麻痹，上睑下垂等;获得性(acquired)，包括外伤性，球内或球周占位性病变以及医源性因素，如单眼晶状体摘除后的无晶状体眼，屈光手术，穿透性角膜移植等。
二、屈光参差的发病机理
屈光参差性弱视的发病机理是由于双眼的屈光度数相差较大，外界景物在左右两眼黄斑部所成像的大小不等，医学上称不等视，因两眼屈光参差较大，两眼不同视，两眼视网膜成像大小清晰度不同或大小差别太大，屈光度较高的一眼黄斑部成像大而模糊，引起二眼融合反射刺激不足，不能形成双眼单视，从而产生被动性抑制，这样被动性和主动性抑制同时存在，导致皮质中枢只能抑制屈光不正较大眼睛的物象，日久遂发性弱视，这类弱视也是功能性的，因而可逆的。
两眼屈光相并3.00D以上者，屈光度较高常形成弱视和斜视。弱视的深度不一定与屈光参差的度数有关，但与注视性质有关，旁中央注视者弱视程度较深，这类弱视的性质和斜视性弱视相似，是功能性的和可逆的。临床上有时也不易区分弱视是原发于屈光参差，还是继发于斜视，此型如能早期发现，及时配戴眼镜，可以预防。