乙肝病毒(HBV)侵入人体后，首先与肝细胞膜上的受体结合，脱去包膜，穿入肝细胞质内，然后脱去衣壳，部分双链环状HBVDNA进入肝细胞核内，在宿主酶的作用下，以负链DNA为模板延长正链，修补正链中的裂隙区，形成共价闭合环状DNA。以下是乙肝的具体病因形成过程。
1、以共价闭合环状DNA为模板，在宿主RNA聚合酶II的作用下，转录成几种不同长短的mRNA，其中3.5kb的mRNA含有HBVDNA序列上全部遗传信息，称为前基因组RNA。
2、前基因组RNA进入肝细胞质作为模板，在HBV逆转录酶作用下，合成负链DNA;再以负链DNA为模板，在HBVDNA聚合酶作用下，合成正链DNA，形成子代的部分双链环状DNA。
3、最后装配成完整的HBV，释放至肝细胞外。胞质中的子代部分双链环状DNA 也可进入肝细胞核内，再形成共价闭合环状DNA并继续复制。共价闭合环状DNA半寿 (衰) 期长，很难从体内彻底清除。