预防小儿弱智主要是消除病因，要开展遗传咨询，避免近亲结婚，加强孕期保健。妊娠期间注意营养，避免接触有害化学物质，戒烟、戒酒，绝对禁止摄入毒品，避免服用可能致畸药品，避免接触放射线;预防病毒及原虫感染;做好产前检查，预防妊娠并发症，完善产科技术，避免病理分娩。做好儿童保健工作，实行计划免疫，预防传染病，尤其是神经系统感染，注意营养和卫生，防止中毒，避免脑外伤。宣传育儿知识，提高父母文化水平。
小儿弱智一经产生，很难治好，因此预防十分重要，预防措施包括：提高年青夫妇的健康水平，避免近亲结婚，有遗传病者避免生育，怀孕后有问题者要进行检查诊断，必要时可终止妊娠，及时发现和防治婴幼儿的疾病，特别是神经系统疾病。
学龄前期(6岁左右以前)，积极预防以下病的发生：感染，颅脑外伤，因各种原因引起的脑缺氧，中毒，内分泌或代谢疾病，疫苗接种后脑炎，癫痫，婴幼儿期严重营养不良或其他疾病，因为盲，聋而影响智力发育，以及严重缺乏受教育的机会等。
(1)进行遗传代谢检查及咨询，避免近亲婚姻、发现携带者应进行遗传咨询，做到优生优育。
(2)适龄生育，要做好产前和围产期的保健工作，羊水检查，包括染色体病、神经管畸形、代谢疾病等疾病的检查，高危妊娠管理、新生儿重症监护、劝阻孕妇饮酒吸烟、避免或停用对胎儿发育有不利影响的药物等措施。科学方法接生。
(3)普及卫生教育和营养指导。
(4)做好传染病、病毒、细菌、原虫的免疫接种。
(5)预防各种感染及意外事故的发生，减少颅脑外伤及意外事故，正确治疗脑部疾病、控制癫痫发作。
(6)加强学前教育和早期训练，对学龄前儿童定期进行健康检查(体格、营养、精神心理发育、视觉和听觉)。禁止对小儿忽视和虐待。
(7)对高危新生儿进行随访，早期发现疾病，给予治疗，尤其应该注意，早期营养(蛋白质和铁、锌等微量元素)供应和适当的环境刺激对智力发育有良好作用;注意做新生儿代谢疾病(如甲状腺功能低下、苯丙酮尿症)筛查。