念珠菌性阴道炎的病原体主要是白色念珠菌。白色念珠菌为条件致病菌，约10%非孕妇女及30%孕女阴道中有此菌寄生，但不引起症状。有念珠菌感染的阴道pH在4.0~4.7.一般<4.5。当阴道中糖原增多，酸度增加，局部细胞免疫力下降时，适合念珠菌繁殖引起炎症，故多见于孕妇、糖尿病人及接受大量雌激素治疗者。长期应用广谱抗生素致阴道正常菌群失调，穿紧身尼龙裤，会阴局部湿度及温度升高，也有利于念珠菌繁殖：少部分患者也可以通过性交直接传播或接触感染者的衣物而致病。
妊娠期妇女阴道上皮糖原含量升高，阴道酸性增强，为念珠菌繁殖提供了有利条件，故孕期妇女念珠茵阴道炎发病率显著高于非孕妇女。近年有研究认为，念珠茵作为一种变应原，可诱导机体产生特异性免疫应答。
与健康妇女相比，复发性阴道念珠菌病(recurrent vaginal candidiasis，RVC)患者阴道受损粘膜和外周血单核细胞产生白色念珠菌特异性T细胞克隆比例增高，经白色念珠菌刺激后单核细胞产生的γ一干扰素减少，提示复发性阴道念珠菌病患者可能存在某种程度的T细胞反应缺陷。
此外，长期应用抗生素，改变了阴道内微生物之间的相互制约关系;皮质类固醇激素或免疫缺陷综合征，使机体的抵抗力降低;穿紧身化纤内裤、肥胖可使会阴局部的温度及湿度增加，也易使念珠菌得以繁殖而引起感染。
霉菌性阴道炎的传染途径
1、间接接触传染也是霉菌性阴炎的一条传播途径。接触被霉菌患者感染的共厕所的坐便器、浴盆、浴池坐椅、毛巾，使用不洁卫生纸，都可以造成传播。
2、性传递也是导致发生的原因之一。女方有症状者至少有10%的男方患有霉菌性尿道炎，应同时给予合理治疗以防交互感染。
3、大量服用抗菌素。服用抗生素改变了阴道的微环境，致病的细菌病源体就可能繁殖，最终导致局部的霉菌性阴炎发作。
4、过度讲究卫生：有些女性为了保持卫生经常使用药用洗液来清洗阴道，这样很容易破坏阴道的酸碱环境，反而容易感染上念珠菌性阴道炎。
5、糖尿病、怀孕期都可能造成阴道的念珠菌大量繁殖带菌率增高。
此外，维生素缺乏(复合维生素B)、严重的传染性疾病，和其他消耗性疾病均可成为白色念珠菌繁殖的有利条件。妊娠期阴道上皮细胞糖原含量增加，阴道酸性增强，加之孕妇的肾糖阈降低，常有营养性糖尿，小便中糖含量升高而促进白色念珠菌的生长繁殖。