心脏神经官能症的病因仍不明确，本病与一般神经症一样，主要是由于工作与生活过度紧张、焦虑或与人尖锐矛盾产生精神创伤，大脑皮质受到强烈刺激而使大脑皮质兴奋与抑制过程产生障碍，导致中枢神经功能失调，自主神经功能紊乱，造成心脏血管功能异常。本病的发生与下列因素有关。
1、家族性
同一家族或相同的环境作用下易患神经症倾向。往往同一家族父母、兄弟、姊妹均有不同程度的神经症表现。
2、神经类型内向
患者情感脆弱、较抑郁、多愁善感，精神上稍受刺激或工作较紧张，即可诱发本病。
3、喜静少动
患者平时缺乏运动锻炼，在一时较剧烈运动、心脏负担较重，心跳较快或出现期前收缩，便过分注意心脏而致发病。
4、缺乏对心脏病认识
患者看到亲人或同事有心脏病或听到某心脏病患者猝死，便忧心忡忡，可诱发本病。
5、医源性
由于医务人员诊断上错误或解释工作不足，将非器质性心脏病误诊为心脏病，如将无害性心脏杂音误诊为二尖瓣闭锁不全，把窦性心律不齐作为心律失常，一时性血压升高当作高血压病，都可造成患者精神负担过重、紧张、焦虑而诱发本病。
心脏神经症的病因和神经官能症相似，被认为可能与体质、神经、行为、外界环境、遗传等因素有关。患者的神经类型常为弱型，其家庭成员中可有神经官能症。此类病人平时活动范围较为狭小，对环境事物较为淡漠、不感兴趣，多惯于抑制其情绪，抑郁和焦虑忧愁。在各种外来的负荷、刺激或劳损如精神上受到刺激或工作较紧张时，往往不能使自己适应于这种环境而易发病或使症状加重。家属中有较严重心脏病患者或有因心脏病而骤死者也常可诱发本病。
心血管系统受神经和内分泌系统的调节，其中神经系统的调节起主导作用。交感神经使窦房结冲动发放加快，而迷走神经使窦性心律减慢。当中枢神经系统功能失调时，交感和迷走神经的正常活动也受干扰，心血管系统的功能因而发生紊乱，产生一系列交感神经张力过高的表现。精神、环境等的刺激可引起各种生理改变，主要表现为交感神经活性增加和肾上腺皮质激素分泌增加。临床研究还显示本症患者对运动、心理学试验和疼痛刺激有异常反应，如运动时最大氧耗量较正常人为低和动静脉血氧含量差降低以及毛细血管血流减慢、血乳酸盐增多等。普萘洛尔等β肾上腺素能受体阻滞药治疗心脏神经症的疗效较好。这些患者同时伴有高动力循环的表现，如左心室喷血速度增快、心排血量增加、动脉搏动增强和偶见的收缩压升高。经普萘洛尔治疗上述表现可全部消失，更进一步支持本症存在β肾上腺素能受体功能亢进综合征。