慢性肾盂肾炎根据其临床表现可分为血尿型、高血压型和隐匿型，应分别与引起血尿的其他疾病、高血压病、无症状菌尿等相鉴别。通过详细询问病史，观察肾和尿路症状、体征以及反复做尿常规、细胞和细菌学检查，必要时作肾X线检查等。非感染性慢性间质性肾炎起病隐匿，临床表现多样，尿与肾功能化验与慢性肾盂肾炎相似，易混淆。
非感染性慢性间质性肾炎的特点
1.有较长期尿路梗阻或有长期接触肾毒性物质史;
2.有肾小管功能障碍;
3.氮质血症，但无水肿和高血压病史;
4.轻度蛋白尿，进一步检查为肾小管性蛋白尿;
5.静脉肾盂造影可见双侧肾影不等，外形不规则，可有肾盏变形;
6.肾图、核素扫描或B超显像，可显示双侧肾脏病变不相等。
慢性肾盂肾炎与其不同的主要表现
慢性肾盂肾炎与其不同的主要表现为尿路刺激症状、间歇性真性细菌尿;静脉肾盂造影有慢性肾盂肾炎征象，即局灶的、粗糙的皮质瘢痕，伴有邻近的肾小盏变钝或呈鼓槌状变形。肾盂有时亦可变形，有扩大、积水现象。如鉴别仍有困难，可考虑作肾活检，有助于确诊或排除其他慢性肾脏疾病。