三叉神经痛得诊断一般来说是较容易的。诊断主要来自于患者的临床表现，一般不需要进行特殊的辅助检查，当怀疑为继发性三叉神经痛时，应有针对性地进行检查。
三叉神经痛的主要诊断要点如下
1. 发痛部位主要为以下三叉神经分支部位，为眼睛上下，颧骨上下，及嘴部上下位置。
2. 多为突然发作的阵发性剧痛，不发作时绝大部分患者完全不痛，仅极少数患者仍有轻度疼痛。
3. 大多数患者有“扳机点”即触发点，刺激这些点可引起疼痛发作，但发作刚过去，再刺激“扳机点”则不引起发作。
4. 95%以上的三叉神经患者为一侧性，疼痛发作时不合并恶心、呕吐。
5. 早期吃“卡马西平”等抗神经痛药物治疗有效，对一般如“去痛片”等镇痛药物无效。
6. 病程冗长，呈逐渐进展趋势发展。
三叉神经于其他疾病的鉴别
(一) 三叉神经支炎
属继发性三叉神经痛，此病发生在眼眶之上，是持续性的疼痛，发作后数日，部分患者会出现带状疱疹病毒。此病可自行好转，对于应用镇痛药物、维生素或局部麻醉药、激素皆有效。
(二) 牙痛
细看牙有无病变，牙痛阵发性不明显，于食物冷热关系很大。
(三) 舌咽神经痛
疼痛为阵法性，大多数在吞咽时发作，其次点头、说话、大笑均可引起发作，
疼痛部位一般是耳根和嘴角连线，以下的方向。
(四) 血管性偏头痛
血管性偏头痛是周期性、轻重不等的单侧头痛，自身多感觉为脑部深处胀痛，三叉神经痛多感觉为脸部表浅的疼痛。