(1)膀胱颈纤维化增生-膀胱颈挛缩
多由慢性炎症引起，膀胱颈部平滑肌为结缔组织所代替。发病年龄较轻，一般在40～50岁出现症状，临床表现与前列腺增生相似，但检查前列腺不增大。膀胱镜检查是最可靠的鉴别诊断方法。
(2)前列腺癌
前列腺癌和前列腺增生多发生于老年人。这是两种不同起源的疾病，前列腺癌多发生于前列腺外周区，而前列腺增生发生于前列腺移行区和尿道周围腺区。两种疾病可同时存在。两者有类似的临床症状，但在较晚期的前列腺癌，直肠指诊和B超检查两者有明显的不同，前列腺增生时腺体增大，表面光滑，富于弹性，中央沟变浅或消失;而前列腺癌则为质地坚硬，界限不清的结节或肿块。B超检查前列腺增生时包膜回声连续，内部光点均匀;前列腺癌则包膜回声不连续、界限不清。前列腺活检可做出确切鉴别。临床上应重视对较早期前列腺癌的发现，对前列腺增生患者应仔细做直肠指诊，发现前列腺结节或临床怀疑前列腺癌时应做穿刺活检，以排除前列腺癌。
(3)神经源性膀胱功能障碍
可引起排尿困难、尿潴留，也可继发泌尿系感染、结石和肾积水，临床表现与前列腺增生相似，老年患者容易误诊为前列腺增生。但神经源性膀胱功能障碍常有明显神经系统损害的病史和体征，如下肢感觉和运动障碍，便秘，会阴部感觉减退或丧失，肛门括约肌松弛，收缩力减弱或消失，应用尿流动力学检查可明确诊断。但应注意两者同时存在的可能。
(4)尿道狭窄
尿道狭窄时出现排尿困难，患者多数有尿道炎症、外伤或尿道器械检查损伤病史。用尿道扩张器探查，尿道口径缩小，尿道造影可见狭窄段尿道僵直变细。查前列腺体不见增大。