腹泻在6个月2岁之间的婴儿之间发病率最高，小儿腹泻也是引起小儿营养不良的和生长发育障碍的主因。综合来讲，小儿腹泻的原因分感染性和非感染性两大类。
肠道内感染
由于细菌、病毒、真茵或原虫等，随食物进入消化道，或通过污染的用具、手、玩具传播，或食物腐败、变质、细菌繁殖后的食物进入体内，引起消化道疾病，出现腹泻。
1、病毒感染
在寒冷季节婴幼儿的腹泻约80%由病毒感染引起，最常见的是轮状病毒的感染，(常发生在每年的10-12月，又称为秋季腹泻)，其次有星状和杯状病毒，肠道病毒(包括柯萨奇病毒、埃可病毒、肠道腺病毒)诺沃克病毒、冠状病毒等。
2、细菌感染
细菌引起的腹泻以致病毒性大肠杆菌和痢疾杆菌感染最常见，常发生在每年的6-8月，又称夏季腹泻。
(1)致腹泻大肠杆菌
根据引起腹泻的大肠杆菌不同致病毒性和发病机制，已知菌株可分为5大组。
A、致病性大肠杆菌
它侵入人体肠道后，粘附在肠粘膜上皮细胞，引起肠粘膜微绒毛破坏，皱壁萎缩变异，粘膜充血，水肿而致腹泻，可累及全肠道。
B、产毒性大肠杆菌
可粘附在小肠上皮刷状缘，在细胞外繁殖，产生不耐热肠毒素和耐热肠毒素，引起腹泻。
C、侵袭性大肠杆菌
可直接侵入小肠粘膜引起炎症反应，也可粘附和侵入结肠粘膜，导致肠上皮细胞炎症和坏死，引起痢疾样腹泻，此菌与志贺菌相似，两者抗原有交叉反应。 D、出血性大肠杆菌：粘附于结肠产生于志贺杆菌相似的肠毒素，引起肠粘膜坏死和肠液分泌，致出血性肠炎。
E、粘附一集聚性大肠杆菌
以集聚方式粘附于下段小肠和结肠粘膜致病，不产生肠毒素，也不引起组织损伤。
(2)空肠弯曲菌
肠炎有关的弯曲菌有空肠型、结肠型和胎儿亚型3种。致病菌直接侵入空肠、回肠和结肠粘膜，引起侵袭性腹泻，某些菌株也会产生肠毒素。
(3)耶尔森菌
除侵袭小肠、结肠粘膜外，还可产生肠毒素，引起侵袭性和分泌性腹泻。
(4)真菌
致腹泻的真菌有念珠菌、曲菌、毛霉菌，小儿以白色念珠菌为多见。 (5)寄生虫：常见为蓝氏贾第鞭毛虫、阿米巴原虫和隐孢子虫等。
肠道外感染有时亦可产生腹泻症状，如患中耳炎，上呼吸道感染、肺炎、泌尿道感染、皮肤感染或急性传染病时，可由于发热、感染原释放的毒素、抗生素治疗，直肠局部激惹(膀胱感染)作用而引起消化功能紊乱导致腹泻，在医学上称之为症状性腹泻。有时病原体(主要是病毒)可同时感染肠道。
滥用抗生素也可引起腹泻，除了一些抗生素可降低碳水化合物的转运和乳糖酶水平之外，肠道外感染时长期大量地使用广谱抗生素可引起肠道菌群紊乱，肠道正常菌群减少，耐药性金黄色葡萄球菌、变形杆菌、绿脓杆菌、难辨梭状芽胞杆菌或白色念珠菌等可大量繁殖，引起药物较难控制的肠炎，有学者称之为抗生素相关性腹泻。
温馨提示
小儿腹泻的感染性原因多是由食物不干净引起，妈妈们除了日常保证宝宝饮食数量外，也要让宝宝远离受污染的食品或者过期食品。