应根据病史，结合上述症状及体征进行诊断，而不应以单纯扁桃体的大小为依据，因为随着年龄的增长，扁桃体在不断缩小，慢性扁桃体炎分为三种类型，即增生型、纤维型和隐窝型，所以扁桃体的大小并不表明其炎症程度，故不能以此作出诊断。
按其病理变化，可分三型。
1、增生型
多见于儿童。扁桃体淋巴组织增生，淋巴滤泡增多，结缔组织增加，扁桃体慢性充血、肥大。
2、纤维型
多见于成人。扁桃体淋巴组织萎缩，间质内纤维瘢痕组织增生，隐窝口阻塞，扁桃体变小而坚韧。
3、隐窝型
主要病变深居扁桃体隐窝内，淋巴滤泡呈慢性炎症，淋巴组织瘢痕化。由于隐窝口被瘢痕组织阻塞引流不畅，以致隐窝明显扩大，或有大量脱落上皮、细菌、淋巴细胞和白细胞聚集形成脓栓。因病情重易产生并发症，又称慢性脓毒性扁桃体炎。
病人常有咽痛，易感冒及急性扁桃体炎发作史。平时自觉症状较少，可有咽部不适，异物感，刺激性咳嗽，口臭或微痛。小儿扁桃体过度肥大，常有呼吸不畅、鼾声、语言含糊及进食缓慢等症状。由于经常咽下炎性分泌物，刺激胃肠道或隐窝内细菌，毒素被吸收引起全身反应，导致消化不良、食欲不振、倦怠无力、易疲乏、消瘦、头痛、低热等症状。
检查见舌腭弓及扁桃体慢性充血，粘膜呈暗红色。扁桃体多与前、后弓炎性粘连;表面或平整，或凹凸不平，或呈分叶状。有时可见线状瘢痕，扩大的隐窝开口及干酪样栓或粘膜下黄白色斑点。用压舌板于舌腭弓外侧挤压扁桃体，可有分泌物从隐窝口溢出。下颌角下常可触及肿大的淋巴结。
在儿童，急性扁桃体炎发病率很高，尤其在3～4岁以后少年儿童及青年较为多见，50岁以后因扁桃体萎缩，则炎症少见。扁桃体炎也与季节有关，如冬春季节，天气变化无常，儿童容易受凉、感冒，所以他们最容易患急性扁桃体炎或慢性扁桃体炎急性发作。 扁桃体急性发炎时，采用青霉素类抗革兰氏阳性细菌抗生素或消炎药物，治疗效果很好。加上适当的休息，注意营养，一般在1周左右就可恢复正常。
如果炎症反复发作，则可转化成慢性。慢性扁桃体炎的症状不很明显，主要是咽痛。咽干、咽部不适、有口臭等表现。由于炎症的原因扁桃体常常比较肥大，但也有少数扁桃体萎缩而仍有慢性炎症者，并常合并伴有慢性咽炎。检查可见扁桃体表面充暗红色血、表面有瘢痕、及粘连、凹凸不平，腭舌弓亦可有慢性充血，有时颌下淋巴结也可肿大。慢性扁桃体炎也可用抗菌消炎药物，如反复急性发作，则需要施行手术切除，但一般5周岁以下儿童不适宜于手术治疗，多采用保守治疗，因其尚有一定的免疫作用。