按粒细胞动力学和病理生理，本症可分为四类：
(一)骨髓损伤
1.药物引起的损伤
抗肿瘤药物和免疫抑制剂都可直接杀伤增殖细胞群，药物抑制或干扰粒细胞核酸合成，影响细胞代谢，阻碍细胞分裂。药物直接的毒性作用造成粒细胞减少与药物剂量相关。其它多类药物亦可有直接的细胞毒性或通过免疫机制使粒细胞生成减少。
2.化学毒物及放射线
化学物苯及其衍生物、二硝基酚、砷等对造血干细胞有毒性作用，X线和中子能直接损伤造血干细胞和骨髓微环境，造成急性或慢性放射损害，出现粒细胞减少。
3.异常细胞浸润骨髓
癌肿骨髓转移、造血系统恶性病及骨髓纤维化等造成骨髓造血功能的衰竭。
4.免疫因素
自身免疫性粒细胞减少是自身抗体、T淋巴细胞或自然杀伤细胞作用于粒系分化的不同阶段，致骨髓损伤，粒细胞生成障碍。常见于风湿病和自身免疫性疾病时。
5.全身感染
细菌感染如分支杆菌(特别是结核杆菌)及病毒感染如肝炎病毒等。
6.细胞成熟障碍——无效造血
如叶酸和维生素B12缺乏，影响DNA合成，骨髓造血活跃，但细胞成熟停滞而破坏于骨髓内。某些先天性粒细胞缺乏症和急性非淋巴细胞白血病、骨髓异常增生综合症、阵发性睡眠性血红蛋白尿也存在着成熟障碍，而致粒细胞减少。
(二)血管外组织内的粒细胞需求增加
(三)周围循环粒细胞分布异常
(四)混合因素
如慢性特发性粒细胞减少症、周期性粒细胞减少症等。临床上上述三类白细胞减少常混合存在，宜注意分析。