1、口腔
反复发作的口腔黏膜溃疡，与复发性口疮类似。多表现为轻型或疱疹样型，亦可出现重型。溃疡始发于舌尖、舌缘、唇、颊、口底等角化较差区域，数目不等，圆或椭圆型，微凹，表面可有黄色假膜，周围有充血红晕，灼痛明显，口腔溃疡是BD最常见的首发症状和必发症状。
2、生殖器
主要为外生殖器溃疡，常反复发作，但间歇期远大于口腔溃疡。溃疡多见于大小阴唇、阴茎、龟头、阴囊，形态与口腔溃疡相似，直径较大，可达0.5cm左右。溃疡数目虽少，但因该处易受感染和摩擦，常愈合较慢，疼痛剧烈。
白塞病尽管有会阴部溃烂，但不是感染所致。白塞病为自身免疫性疾病，不会传染。生殖器溃疡发生率虽然高，但低于口腔溃疡。
3、皮肤
主要表现为反复发作的结节性红斑，面部毛囊炎、痤疮样皮疹、皮下血栓性静脉炎和皮肤针刺反应。最常见典型的是结节性红斑，多发生在四肢，尤以下肢多有。
4、眼
眼部病变可分为眼球前段病变和后段病变。前段病变主要包括虹腊睫状体炎、前房积脓、结腊炎和角膜炎。后段病变主要为脉络膜炎、视神经乳头炎、视神经萎缩和下班体病变、继发性白内障、青光眼、视网膜剥离、黄斑区变性、眼球萎缩。
病损开始往往是单眼和眼球前段病变，以后发展为双眼和眼球后段病变。
还有一类少见症状
关节
主要累及膝、腕、肘、踝等大关节，与风湿性关节炎症状相似，但无游走性，有肿痛红热。易复发。
心血管系统
血管症状为主要特征。以往常被忽视，男性多发。
静脉
主要表现为静脉炎和静脉血栓、闭塞。临床表现为单纯红斑，圆形或卵圆形，直径数毫米，有轻度疼痛，可自行消退。
动脉
主要表现为动脉炎、动脉狭窄、闭合和动脉瘤常因动脉瘤破裂引起严重出箅而导致死亡。
心脏
可表现为心肌炎、心包病变、心肌梗塞、心瓣膜脱垂、心脏扩大等，但病变罕见。
消化系统
临床表现以发热、腹痛、恶心、呕吐及消化道出血为主。回盲部肠道黏膜溃疡多见，肠出血少见，而发热、消瘦、贫血等全身症状较严重。
神经系统
包括脑膜炎症群;脑干症群;周围神经损害症群;脊髓症群。
呼吸系统
肺部病变多见，表现为发热、胸痛、咳嗽、咯血(肺部大咯血抢救不及时会危及生命此外还可发生胸膜积液、肺门淋巴结病。