传统的物理治疗方法，如冷冻、激光、电烙、手术等，仅仅能够破坏疣体表面组织，术后必须另外进行抗病毒治疗，患者痛苦大，治疗时间长，费用昂贵，也容易因为人体自身免疫能力下降而反复发作。
资料显示表明，如果单纯采用激光等方法治疗，47.5%的病人在一个月以后即复发，并易留下巴痕，影响愈后正常的夫妻生活，给患者带来长期的精神痛苦。三氯醋酸或其他腐蚀性强的药物，以单纯腐蚀消除疣体为目的。虽然见效快，价格低廉，但与物理治疗方法一样，虽然能在短时间内消除疣体，却不能消除亚临床感染，故而极易复发。
患尖锐湿疣后，一定要积极治疗，彻底根治。找专科医师，专科医院治疗是最佳的选择，否则不适当的治疗和刺激可加快恶变。
另外，需要注意的是，部分病例为亚临床感染或HPV病毒携带者，无肉眼可见的临床表现。孕妇患尖锐湿疣后，人乳头状瘤病毒可通过分娩过程传染给婴儿，使之发生喉头疣及引起喉部乳头状瘤。即使母体感染后无临床症状，病毒也可通过血液或胎盘传播给胎儿，所以患有此病的妇女足月妊娠时，以做剖腹产术为妥。