遗传因素
X染色体缺失或畸变可导致已形成的卵泡萎缩退化。
卵巢手术
卵巢部分切除、卵巢囊肿剥除或一侧附件切除术后，以及放疗、化疗均可损伤卵巢，引起卵巢早衰。
感染
儿童期病毒性腮腺炎可能引起早期严重的卵巢损害;严重的感染如输卵管、卵巢脓肿，可破坏卵巢组织，导致卵巢早衰。
垂体功能异常
促性腺激素过度刺激，可加速卵泡闭锁，使卵泡消耗过多。
免疫因素
卵巢早衰常并发甲状腺炎、系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎。此时，患者外周血中有抗卵巢抗体，抗体与卵巢中相应细胞结合后会损伤卵泡而致使卵巢功能衰竭。
特发性卵巢早衰
无明确诱因的过早绝经，染色体核型为46XX，通常测不到自身免疫抗体，为卵巢早衰的最常见类型。