一、与男、女性淋病鉴别的疾病
(1)非特异性尿道炎：常有明显的发病诱因，如插导尿管、尿道探子、泌尿生殖道或邻近器官的炎症等病史。分泌物涂片染色可检出Gram阳性球菌。
(2)NGU：临床症状与淋病类似，但较轻，潜伏期比淋病长，达1～3周，分泌物量少且呈浆液性，排尿困难极少见，无全身症状，取分泌物作检查时常可发现衣原体或支原体。
(3)软下疳：损害一般位于外生殖器部位，发生于尿道口、舟状窝者有脓性分泌物，尿道口红肿和剧痛，溃疡处可检出Ducrey嗜血杆菌。
(4)生殖器疱疹：为HSV引起，损害为集簇性水疱，一般位于外生殖器、肛周，偶见于宫颈，发生于尿道者可有少量分泌物及尿道刺痛或不适，常伴局部烧灼感，疼痛明显，可反复发作。
(5)固定型药疹：有服药或注射用药史，多由磺胺类、巴比妥类、水杨酸盐类或四环素类等引起。常于外生殖器皮肤黏膜交界处发生红斑、水肿、水疱、糜烂及渗出等，伴瘙痒或疼痛，尿道口无红肿及外翻等。
(6)结核性尿道炎：可有尿道刺痛及少量分泌物，但无性接触史，查不到淋球菌，可查见结核杆菌，伴有其他部位结核的症状。
二、与男性淋病鉴别的疾病
(1)包皮龗头炎：常见于包皮过长或包茎者，多由包皮垢刺激及继发化脓菌感染所致，包皮内叶、龗头及冠状沟红肿，有较多的污垢及脓性分泌物，无泌尿道症状及尿道口红肿、流脓等。
(2)尿混浊：尿液呈乳白色，静置后有盐类结晶的沉渣，不伴有自觉症状。
三、与女性淋病鉴别的疾病
(1)念珠菌性阴道炎：外阴及阴道口瘙痒，白带较多，如水样或凝乳状，阴道黏膜红肿、糜烂，可有白膜附着于阴道壁，取白膜涂片镜检可见菌丝及孢子。
(2)滴虫性阴道炎：自觉阴道内有蚁行样瘙痒，阴道分泌物常呈粉红色泡沫状，阴道黏膜多有出血，宫颈可有草莓状突起物和点状出血，阴道分泌物中可检出滴虫。
(3)细菌性阴道病：主要为顽固性白带增多，呈灰白色，非化脓性，并带有“鱼腥样”气味，从阴道分泌物中可检出Gardner杆菌和厌氧菌。
(4)幼女金葡菌性外阴炎：多见于学龄前或学龄期女孩，好发于夏季，外阴、肛周红肿，有脓疱或脓性分泌物、伴疼痛或瘙痒，分泌物涂片可检出Gram阳性球菌。
四、与GPID鉴别的疾病
有急性阑尾炎、感染性流产、盆腔子宫内膜异位症、异位妊娠、卵巢囊肿蒂扭转或破裂等。