在甲状腺肿瘤诊断时，不要过份依赖肿块表面不平和质地坚硬作为甲状腺癌的特征。有些甲状腺癌的肿块可以很柔软，光滑，活动度也大，这在乳头状腺癌中並不少见。相反，钙化严重的甲状腺癌瘤、结节性甲状腺以及硬化性甲状腺炎质地较硬，表面有颗粒感，易误诊为甲状腺癌。认为甲状腺结节囊性病变都属良性，这显然是不全面的。有报道囊性病灶恶变率为1.4%，甲状腺癌的囊变率也随其结节长大而增高。
上述检查不能确诊时，可行细针抽吸细胞学检查，宜在手术前1日进行，诊断符合率高。在10%病例中不能作出进一步的细胞分类，仍需手术探查，作组织学检查。
对甲状腺髓样癌，可应用血清降钙素测定以及给钙或五肽胃沁素刺激试验来作出诊断。
个别病人所患的甲状腺癌恶性度较高，首先表现为转移癌而肿大的颈淋巴结，原发甲状腺癌反而未被病人察觉，一般说来，甲状腺单发结节较多发结节或结节性甲状腺肿更有可能为恶性。病人有下列表现者应警惕癌性结节的可能。
①在地方性甲状腺肿非流行区，14岁以下儿童的甲状腺单个结节，其中10%～50%是恶性。但都是分化好的甲状腺癌。
②成年男性甲状腺内的单发结节。
③多年存在的甲状腺结节，短期内明显增大。
④滨海居住的患者，单发结节为癌的机会远比来自地方性甲状腺肿流行区的患者为高。
⑤儿童期头颈部曾接受过放射治疗的患者，甲状腺单个结节更可疑。
⑥查体表现结节质地坚硬，固定不规则或伴同侧颈部淋巴结肿大。声带麻痹。
⑦颈部拍片示甲状腺内的钙化阴影为云雾状或颗粒状。边界不规则，甲状腺癌导致的气管狭窄常常是左右径、前后径可以正常。
⑧B超检查呈实性或囊实性，内部回声不均匀，边界不清楚和不规则。
⑨穿刺检查发现肿瘤细胞，对囊性肿物抽出液可能逐渐变为暗红色，这是甲状腺乳头腺癌转移灶的一种特征。
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