多以淋巴结转移为主。颈部的淋巴结可分为I-VI区，一般II-VI区淋巴结和甲状腺癌转移有关。通常VI区淋巴结又称为中央组淋巴结，包括气管食管沟、气管前和喉前淋巴结;II-V区淋巴结又称为颈侧区淋巴结，包括颈部大血管周围淋巴结和副神经周围淋巴结。中央组淋巴结由于多位于甲状腺后方且直径很小，一般颈部B超难于发现;而颈侧区淋巴结则可通过B超检查发现是否有转移。
多数情况下，一侧甲状腺乳头状癌多转移至同侧的淋巴结，但个别也可转移至对侧的淋巴结。淋巴结转移的途径一般是先转移至中央组淋巴结，然后再转移至颈侧区淋巴结;但也有个别癌肿如位于甲状腺上极的肿瘤可首先转移至颈侧区的淋巴结。文献报道，不管肿瘤大小如何，通常中央组淋巴结转移率可达50%左右。有鉴于此，最新一期我国分化型甲状腺癌的指南强调中央组淋巴结的清扫。但对于甲状腺的切除范围，可根据肿瘤的分期、各地的医疗条件和病人对疾病的认识程度实行个体化方案，但至少要切除患癌侧腺叶峡部。
甲状腺滤泡状癌
多通过血行远处转移至肺、骨、脑和肝等器官，比较合理的手术方案是行双侧甲状腺的全/近全切和患侧中央组淋巴结清扫，然后行碘131治疗。但由于术中冰冻病理切片多难确定滤泡状癌，因此常需行再次的补充手术。
根据国外经验，由于分化型甲状腺癌预后较好，因此如果手术切除彻底，术后再辅以碘131巩固治疗。碘治疗结束后终身服用甲状腺素制剂行抑制治疗往往可达到根治的效果。但对于术后甲状腺残留较多的分化型甲状腺癌，由于碘治疗无法起到巩固治疗的效果，同时反复多次碘治疗过程中停用甲状腺素制剂可引起肿瘤复发或去分化，因此，对于甲状腺残留较多的病人，多建议服用甲状腺素制剂行抑制治疗。至于甲状腺素抑制治疗的剂量要根据肿瘤的分期因人而异。