人乳头瘤病毒主要就是引起人体皮肤黏膜的鳞状上皮增殖，根据侵犯的组织部位不同可分为低危型与高危型。低危型表现一般即为寻常疣、扁平疣、跖疣等，高危型表现亦为赘生疣状物但其油状表皮发育不良已发生恶变从而导致皮肤癌。
检查
1、电镜检查
HPV是最早在电镜下观察到的病毒之一，将活检标本负染，若能在电镜下见到特征性的病毒颗粒，即可作出诊断;而用免疫电镜可提高检出率。电镜检查法虽然准确率很高，但费时，需特殊仪器设备，且检出阳性率很低。
2、PCR技术
应用此法可检测HPV-DNA，还可进行基因分型。灵敏度可达1fg，该法操作简便省时，而且标本来源不受限制，如病变组织或脱落细胞，分泌物或黏液，新鲜标本或保存已久的石蜡切片等标本均可。
3、血清学检查
目前尚不能用血清学方法对HPV进行确诊及分型。为发展型特异性血清学试验现正在研究试用基因工程表达产生的晚期蛋白来检测患者血清中相应的抗体。初步认为，L1和L12蛋白可用于检测HPV型特异性免疫应答。
4、核酸杂交技术
核酸分子杂交技术不仅能对HPV进行确诊，而且还能对HPV进行分型。利用放射性核素或生物标记的HPV-DNA探针来检测患者标本中是否存在互补的核酸链。最常用的方法为斑点杂交法，其次为DNA印迹法及原位杂交。
5、内镜检查
要发现阴道、肛门及直肠、尿道等部位的生殖器疣则分别需借助阴道镜、肠镜以及尿道镜等内镜检查，凭外观特征进行诊断。
鉴别
应与下列疾病相鉴别
1、疣状皮肤结核
需与寻常疣相鉴别，但它为不规则的疣状斑块，周围有红晕，常伴有结核中毒症状。
2、鸡眼
需与跖疣鉴别。其压痛明显，表面平滑。
3、毛囊上皮瘤及汗管瘤
有时需与扁平疣相鉴别。此两者好发于眼附近，组织学改变完全不同。
4、乳头状瘤
较尖锐湿疣大，有的直径可达4～8cm，病程慢，常无症状，多发生在老年妇女，需送病理检查确诊。
5、二期梅毒扁平疣
多为单发，边缘清楚、整齐，基底平坦清洁，质硬而不痛的硬性下疳。梅毒血清反应可作为诊断依据。
6、生殖器鳞状细胞癌
多见于40岁以上的人，无不洁性交史，浸润损害明显，常形成溃疡，组织病理检查可以确诊。
人乳头瘤病毒患者不要接触本病病损处，防止带有HPV的渗出物污染公共环境，做好浴盆、浴巾、马桶的清洁、消毒。有肛门及外生殖器疣者应先进行诊断及治疗，性交时男性应使用避孕套，以防止生殖器HPV相互感染。