髓内肿瘤因其部位特殊，周围被“脆弱”的、损伤后不易恢复的脊髓包围，治疗方法选择上存在着一些分歧。一些学者主张起源于髓内胶质的肿瘤应以放射治疗为主，如有的作者认为手术以活检确立诊断的程度为宜，放疗为最好的治疗方法。
但是另一些学者诊断脊髓内肿瘤界限清楚的应尽量予根治性手术切除。有作者报告11例髓内肿瘤完全切除9例，其中5例星形细胞瘤3例完整切除，术后神经功能稳定或恢复良好。李有忠等报告17例脊髓髓内肿瘤，9例全部切除，其中室管膜瘤7例，星形细胞瘤1例，血管瘤1例。解放军总医院的一组资料认为肿瘤Ⅰ期切除是比较积极的治疗方法。
鉴于室管膜瘤以膨胀性生长为主，肿瘤与邻近脊髓组织分界较清，为髓内肿瘤中最有希望根治性切除的一种。室管膜瘤MRI常表现为实质和囊性两部分组成。前者为肿瘤存活部分，也是手术切除的重要部分。由于周围脊髓水肿部分在T2加权象也呈高信号，故T2异常信号要比实际的肿瘤;而且室管膜瘤为富血管性肿瘤，因此手术时应特别注意。
星形细胞瘤多以浸润性生长为主，肿瘤与邻近组织多分界不清，除个别具有假包膜者外大多都难以完全切除。李有忠等报告17例脊髓髓内肿瘤中4例星形细胞瘤仅1例完整切除。