亚急性甲状腺炎的病因至今尚未明确，因其发病前常有感冒等上呼吸道感染史，研究认为与病毒感染有关。本病起病较急，患者常突然出现颈前疼痛不可触碰，疼痛可牵连头部、颈后部、下颌部、耳后部。大多伴有发热，体温在 37.5℃—39℃，发烧午后明显或加重，晨起可自性消退。
初期伴有心慌、怕热、多汗等甲亢表现。查体甲状腺肿大、质硬或有结节，触痛明显。实验室检查T3、T4 、FT3、FT4升高，血沉增快，白细胞正常或轻度增高。甲状腺吸碘率降低，甲状腺扫描显影稀疏。若病情严重，少数病人后期出现甲减。临床上亚急性甲状腺炎容易与以下疾病造成误诊：
1.上感或咽炎
由于发病早期常有感冒等上呼吸道感染史，继而出现发热、颈前疼痛、咽痛、吞咽加重等，易误诊为上感或咽炎给予抗菌素治疗延误病情。因此对发热有颈咽部疼痛患者要考虑亚甲炎的可能性，进行甲状腺相关检查；
2.甲亢
亚甲炎发病过程中因甲状腺组织被破坏，甲状腺激素大量释放入血致T3、T4 升高，出现心慌、怕热等甲亢症状，容易误诊为甲亢而予大量抗甲状腺药物、甚至手术造成误治。亚甲炎时T3、T4升高而甲状腺吸碘率反而降低出现二者分离现象，可与甲亢相鉴别；
3.甲状腺腺瘤、甲状腺癌
从起病急缓、病程长短、有无伴发突眼等也可资鉴别。亚甲炎引起的甲亢在亚甲炎急性期过后可缓解，不需要用抗甲状腺药治疗。此外亚甲炎引起的甲状腺肿大、结节还有误诊为甲状腺腺瘤、甲状腺癌或结节性甲状腺肿等肿瘤病变而误行手术切除治疗；
4.颈椎病
临床上还有少数甲状腺肿大、结节较轻的患者，因颈部疼痛明显而误诊为颈椎病。
亚甲炎运用糖皮质激素治疗虽然可以很快控制病情，但减药或停药过程中病情常出现发跳或复发。运用中医中药治疗本病疗效显著，副作用少，复发率低。根据亚甲炎的临床特点可以采用以下方法分期辨证治疗。
1.发病初期以发热、疼痛 为重，颈前肿块初起、触痛明显，治以清热解表、散结止痛；
2.中期发热渐轻，颈前肿块质硬疼痛，治以凉血散结、止痛消肿；
3.发展到病变后期或因失治误治，出现甲状腺功能减退，以怕冷、浮肿、腹胀等证为主时，治以温肾健脾、散结消肿。