男性尿路感染的发病率虽较之女性为低，但并不罕见。男婴的发病率高于女婴，男∶女=4∶ 1。部分原因是男婴的先天性泌尿生殖道疾病较多。其他原因有：男婴的抵抗力低，膀胱排尿不全和尿道口粪便污染。青少年男性的尿路感染较少见，中年后渐增，在老年(65岁后)则与女性发病率大致相等，主要原因是细菌性前列腺炎和前列腺肥大(国内统计占36.4%)。
男性尿道口离会阴和肛门较远，又有干燥的龟头上皮包裹尿道口，故一般认为，男性尿路感染是一种“并发病”，即内源性菌丛借宿主泌尿道的结构、功能异常，致防卫能力削弱而发病。其主要发病机理有以下几点：
1.前列腺肥大
前列腺肥大可阻塞尿道致膀胱排尿不全，老年人前列腺液的抗菌能力较弱，而且，前列腺炎的细菌极易侵入膀胱，引起尿路感染，若伴有前列腺结石，也增加了感染机会，而且感染难以消除。
2.其他泌尿道的异常
致使泌尿道异常的后天因素较多，如神经源性膀胱收缩无力、异物、肿瘤、狭窄和因创伤、手术或辐射引起的改变，致膀胱排空功能减退，残余尿量增多。若尿路管腔内压升高或尿路某段过度扩张，或有尿路插管，细菌进入膀胱，易引起繁殖而导致尿路感染的发生。
3.同性恋
据美国文献报道，男性尿路感染与同性恋有关。