目前，溃疡性结肠炎诊断标准中比较通用的有国际Lennard-Jones标准，国内1993年太原全国慢性非感染性肠道疾病学术研讨会制定的《溃疡性结肠炎的诊断及疗效标准》(简称太原标准)。尽管具体内容有所不同，两者的侧重点仍在于排除诊断，内镜及组织学特征。
1、临床表现
有持续性或反复发作熟液巾使、腹痛、不同程废的今身症状。不应忽视少数只有便秘或无血便的患者。眺往文及体检中要注意关节、眼、皮肤、口腔和肝脾等肠外表现。
2、结肠镜所见
①黏膜有多发性浅溃疡，伴充血、水肿，病变大多从宜肠开始，且呈弥漫性分布;
②动膜粗糙呈细颗粒状，豹膜血管模糊，脆易出血，或附有脓性分泌物;
③可见假性息肉，结肠袋往往变钝或消失。
3、黏膜活检
组织学检查为尖性反应，同时常可见糜烂、溃疡、隐窝脓肿、腺体排列异常、杯状细胞减少及上皮变化。
4、肠易激综合征
发病与精神、心理障碍有关，常有腹痛、腹胀、腹鸣，可出现便秘与腹泻交替，伴有全身神经官能症症状。粪便有黏液但无脓血，显微镜检查偶见少许白细胞，结肠镜等检查无器质性病变。
5、结肠血吸虫病
有血吸虫疫水接触史，常有肝脾肿大，慢性期直肠可有肉芽肿样增生，可有恶变倾向;粪便检查可发现血吸虫卵，孵化毛蚴呈阳性结果。直肠镜检查在急性期可见黏膜有黄褐色颗粒，活检黏膜压片或组织病理学检查可发现血吸虫卵。
6、慢性细菌性痢疾
一般有急性痢疾的病史，多次新鲜粪便培养可分离出痢疾杆菌，抗生素治疗有效。
7、直肠结肠癌
多见于中年以上人群，直肠癌指诊检查时常可触及肿块，粪隐血试验常呈阳性。结肠镜和钡灌肠检查对鉴别诊断有价值，但须和溃疡性结肠炎癌变相鉴别。
8、缺血性结肠炎
多见于老年人，由动脉硬化而引起，突然发病，下腹痛伴呕吐，24～48h后出现血性腹泻、发热、白细胞增高。轻者为可逆性过程，经 l～2周至1～6个月的时间可治愈;重症者发生肠坏死、穿孔、腹膜炎。钡灌肠X线检查时，可见指压痕征、假性肿瘤、肠壁的锯齿状改变及肠管纺锤状狭窄等。内镜下可见由黏膜下出血造成的暗紫色隆起，黏膜的剥离出血及溃疡等，与正常黏膜的明显分界。病变部位多在结肠脾曲。
9、慢性阿米巴痢疾
病变常累及大肠两端，即直肠、乙状结肠和盲肠、升结肠。溃疡一般较深，边缘潜行，溃疡与溃疡之间黏膜多为正常，粪便检查可找到溶组织阿米巴滋养体或包囊，通过结肠镜采取溃疡面渗出物或溃疡边缘组织查找阿米巴，阳性率较高，抗阿米巴治疗有效。