黄体功能不足是引起女性习惯性流产的病因，黄体功能不足的病因可能是来自垂体促性腺激素分泌功能欠佳或LH/FSH分泌的时相与协调不适当，也可因子宫内膜的雌激素增殖作用准备不足或内膜对黄体激素反应欠缺，部分原因可由高催乳素血症引起。近年有报道，黄体缺陷常发生在不孕症的治疗过程中，如临床上常见经克罗米芬治疗后，诱发排卵率虽高而妊娠率相对较低。有人报道，用克罗米芬治疗观察到黄体期缺陷占20%～50%。因此，用诱发排卵药物不应仅观察其是否能促成排卵，还需注意排卵后的黄体功能是否良好。此种现象也可出现于用溴隐亭、HMG加HCG或GnRH脉冲式给药时，故用药后的黄体功能缺陷必须留意观察，加以防治。
正常情况下卵巢排卵后，卵泡将黄素化形成黄体并分泌雌孕激素，分泌量于排卵后7～8天达高峰，然后于月经前1～2天迅速下降。若垂体促性腺激素及雌激素分泌不足，则卵泡发育成熟将不会完善，卵巢虽能排卵，但黄体发育常受影响而出现黄体功能不足的现象。