内分泌失调性不孕的病因复杂繁多，但是其主要目的还是要导致排卵功能异常、造成黄体功能紊乱等。因此，只有确诊导致不孕的内分泌病因才能更好的进行治疗，明确病因后，再采取相应的治疗措施，其目的就是重新诱发排卵，保证黄体功能。
内分泌作为人体的生理机能调控者，利用它分泌的激素在人体发挥作用，意义重大。而一旦出现内分泌激素过少或过多，新陈代谢变得紊乱，就会造成内分泌失调，出现内分泌疾病，自然也会造成严重的后果。
内分泌发生失调其实是与下丘脑至垂体至卵巢这条性腺轴分泌激素量有关，也与新陈代谢功能紊乱等有关。如果发生下丘脑功能性和器质性障碍、垂体功能障碍和垂体腺瘤以及卵巢功能障碍，都会导致卵巢不排卵，从而引发不孕。通常症状表现为月经稀少或断经、功血等。
内分泌失调性不孕在检查的时候会明显发现两侧卵巢包膜增厚和变大，长期观察还可发现患者会出现闭经、肥胖和体毛增多变粗变黑等细微特征。
从中医上来说，内分泌失调是阴虚的表现，是由气血淤滞所造成。淤血滞留体内、脉络受阻、外毒入侵人体、产后恶露不下等都可能会引致气血淤滞。很多女性常见病，其实都是由于内分泌失调所引起。因此，治疗这些病症，要从调节内分泌入手，令气血通畅，使精血滋养全身，促进血液循环，由内而外的全面调理。根据中医的辨证施治原则，对功能亢进者应多注意养阴治疗，而对于功能减退者往往表现有气血两虚、肾虚等，一般是给予补血益气，补肾等治疗，使情况得以改善。
西医指点对于内分泌的失调问题，西医的指导原则当然是调节内分泌，使之重新达至平衡。针对不同的病因、症状及体质、严重程度，会有不同的应对方法。通常对激素分泌过多造成的功能亢进，以抑制、消减为原则，可以采取手术切除内分泌肿瘤，或用药物抑制激素的分泌和合成;对激素分泌过少造成的失调，原则上是补充其不足，包括补充生理剂量激素，器官移植等。
调理内分泌要养成良好的生活方式，形成有规律的生活习惯，保证充分的营养与睡眠，多吃谷物和新鲜水果蔬菜等高蛋白与维生素食物。避免过度劳累与激动，保持精神愉快，以免不良情绪影响到内分泌系统。预防感染不要购买塑料制的生活用品，尽量避免环境激素的危害。及时就医，使用中西药物调理。