物理方法包括冷冻、电灼、高频电刀、外科手术、激光、微波、等离子、伽马刀、利普刀、光动力等。
(一).液氮冷冻或者CO2干冰治疗
冷冻治疗方法的优点有：无开放创面、疼痛轻、出血少、伤口愈合快、无瘢痕以及腔道狭窄形成等。常用于较干燥区域，例如外生殖器、肛周、尿道口、阴茎体、大腿内侧。阴道内避免使用，10~30秒/一次，重复几次，间隔7~14天可以重复使用。如果范围较大，应该分次冷冻治疗，若冷冻后的创面过大(直径大于2CM)，会延期愈合，增加感染机会。
(二)激光治疗
Co2激光输出波长为10.6um，利用其物理特性，起到切割、汽化、烧灼作用。利用聚焦后光束能精确去除病变组织，对正常组织损伤较小。由于激光的热凝固作用，在切割、汽化组织的同时可以封闭小血管、淋巴管，从而起到很好的止血效果，以及防止hpv通过血管与淋巴管循环转移。同时根据hpv耐冷不耐热的特点，激光产生的高温有杀灭此病毒的作用。而且激光治疗与病损组织无机械性接触，手术后感染的机会大大降低，不至于造成2性的感染扩散。故co2激光治疗CA具有一次性的治愈率较高，止血效果好，创面愈合快的特点。特别对阴道壁、宫颈口、尿道口的CA病灶的治疗具有快速、准确去除病损的独到之处。
(三)微波治疗
微波治疗仪的作用机制：CA的治疗以消除疣体的局部症状为主，微波是一种非电离性高频电磁波，具有特殊的生物学效应以及优良的止血作用，微波治疗可以产生凝固，热效应和非热效应，它以生物组织本身为热源，产生不导电的热，从而达到凝固、止血、烧灼的效应，使CA皮损完全消失而治愈。其它治疗方法且听下回分解。