目前尚无根除尖锐湿疣(HPV)的方法，治疗原则为去除外生疣体，改善症状和体征。常需要药物、手术、物理、免疫综合治疗。
1.局部药物治疗
用药前，局部涂以1%的丁卡因行表面麻醉以减轻疼痛。①33%~50%叁氯醋酸外涂，每周1次，一般1-3次后病灶可消退。叁氯醋酸毒性小，对周围正常皮肤无损害，病变修复后不形成瘢痕，可用于阴道及宫颈病变。②1%酞丁安膏涂擦，每日3-5次，4-6周可望痊愈，刺激性小，被广泛应用。③10%-25%足叶草脂涂于病灶，本药具有细胞毒性，能抑制细胞分裂的M期，刺激性大，注意不要涂及正常皮肤，不能用于阴道及宫颈病变，涂药后2-4小时洗去，每周1次，可连用3-4次。④5%氟尿嘧啶软膏外用，每日1次，10~14日为1疗程，一般应用1-2个疗程。
2.物理或手术治疗
物理治疗有微波、激光、冷冻。微波是在疣体基底部凝固，因其为接触性治疗，可适用于任何部位尖锐湿疣。激光适用于任何部位疣及难治疗、体积大、多发疣。冷冻适用于疣体较小及病灶较局限者。巨型尖锐湿疣可用微波刀或手术切除。
3.干扰素治疗
干扰素具有抗病毒、抗增殖及调节免疫作用。可表现为限制HPV病毒的复制;减慢病变部位中细胞的分裂速度;增强宿主对感染HPV的防御反应。常用基因工程重组干扰素(YIFN)a-2a，剂量100万u，隔日肌注1次，连续3-4周为一疗程，也可采用病灶基底部局部注射。干扰素一般不单独使用，多作为辅助用药。 对反复发作的顽固性尖锐湿疣应及时取活检排除恶变。