肛门直肠周围脓肿的症状主要是肛门直肠周围的肿胀疼痛、坠胀，或伴发热等全身感染表现。体征为肛门直肠周围红肿，触及硬结及压痛。根据发生具体位置不同，临床又有以下分类：
一、骨盆直肠窝脓肿。局部症状不明显而全身症状较重。感觉直肠、肛门沉重下坠，频有便意，大便时加重，排尿困难。全身表现为发热、周身疲倦，严重者有毒血症的症状，如头痛、高热、呕吐、大汗出。局部可见直肠粘膜隆起，在提肛肌上可触及肿块、压痛、波动。作脓腔穿刺可抽出脓汁。
二、直肠粘膜下脓肿。局部症状轻，全身症状重。直肠镜下可见直肠粘膜明显的限局性肿胀、发红。直肠指诊可摸到直肠壁上有限局性柔软肿块，压痛、波动，穿刺可抽出脓汁。
三、直肠后间隙脓肿。肛外正常，疼痛可向臀部放射，可出现发热、周身不适等全身中毒症状。可触及直肠后壁肿胀、压痛及波动感。
四、坐骨直肠窝脓肿。局部与全身症状都比较明显，肛缘外一侧或两侧红肿，压痛或有波动。全身表现为感染症状。
五、肛门周围皮下脓肿。全身症状轻，可有发热、全身不适感。局部疼痛。
六、肛门后间隙脓肿。局部疼痛，可见肛门后侧红肿，全身症状轻。
七、肛管粘膜下脓肿。发生在齿线附近，局部疼痛、肿胀、压痛、肛门松弛，粘膜下脓肿常与皮下脓肿相通。
八、括约肌间脓肿。发生在内外括约肌之间，局部疼痛、肿胀、压痛，肛门松弛。
九、马蹄形脓肿。又分为半马蹄形脓肿和全马蹄形脓肿，多为坐骨直肠窝脓肿迁延治疗发展而成，表现特点与坐骨直肠窝脓肿相似。