根据甲亢病因的不同，种类也不同，所以在治疗上也是不一样的，要结合具体的发病原因和特征进行治疗，通常状况下治疗方法包括以下几种。
药物治疗
这是一种较为普遍的治疗方法，是通过口服抗甲状腺药物来达到治疗的效果，适合病情较轻、甲状腺肿大不严重，及老人、儿童等不宜手术的人。在治疗过程中不能擅自停药，这样会增加甲亢的复发几率。大多数人均能耐受，少部分会产生过敏、肝肾功能损害现象，肝肾功能不全患者不能采用此疗法。
手术治疗
此方法是采用将肿大部分的甲状腺切除的原理治疗，适宜中、青年人群。手术要求医生技术性高，如果手术做不好可出现严重低钙、磷现象造成终身手足抽蓄，还可能会有其他并发症的产生，但是其治愈率较高。
放射性碘治疗
这种方法是将碘标记上放射性物质后制成放射性碘，然后进行治疗。此方法安全便利，但是也会对甲亢病人造成影响，即甲减的发生。因对生殖器官的影响较大，年轻少女或未婚女性不宜采用此种方法治疗。另外，母体在摄入放射性碘后，可以通过胎盘或乳汁进入胎儿或婴儿的甲状腺，造成胎儿或婴儿呆小症，孕妇及哺乳期妇女也不宜采用。
中医治疗
中医治疗是通过调节脏腑的功能来促进自身免疫系统的修复，从根本上出发以达到彻底治愈的效果，安全性高，但治疗过程慢长。