肝移植术后的患者，约60%可经证实有过巨细胞病毒感染，但有临床症状的仅为一半。感染分为两种类型：一种为巨细胞病毒阴性受者接受了阳性的供肝或供血，而出现原发性感染;另一种为潜在巨细胞病毒阳性受者的再次发作。
诊断依靠阳性巨细胞病毒培养结果及血清学改变。两种形式感染的发生频率相等，严重程度近似。巨细胞病毒感染可以为轻型发作，表现为短期轻度发热，且不需要治疗，或为严重型发作，伴高热并侵及肺、肝、肾、胃肠道等，有时会出现视网膜炎。
巨细胞病毒肝炎在组织学具有特异性表现，通过肝活检鉴别包涵体及做特异性抗巨细胞病毒血清免疫组织化学法检查，很容易做出诊断。胃肠道弥散性受累，内窥镜检查容易误认为胃炎或结肠炎。因巨细胞病毒致死的，多为间质性肺炎的患者。