一、慢性淋巴细胞性甲状腺炎
目前的治疗对消除该病尚无可靠方法，针对甲状腺大小和甲状腺功能异常可作对症处理。如甲状腺功能正常，甲状腺小、无明显压迫症状可随诊观察，若肿大的甲状腺压迫邻近器官或影响外观，有人提议服甲状腺激素可使甲状腺缩小，而且多数病例最终甲减，早期用药比最终好。桥本病出现甲状腺功能减低者以甲状腺激素替代，L-T4好于甲状腺片，小量开始，逐渐加量，直到腺体缩小，敏感TSH降至正常。当桥本病出现甲状腺功能亢进时若为一过性可使用B受体阻滞剂，即使使 用抗甲状腺药物也应选择小剂量、短时应用;若为桥本甲亢应按毒性弥漫性甲状腺肿治疗，不需手术和碘131放疗，除非抑制治疗后甲状腺肿大压迫或怀疑恶变才 手术。糖皮质激素可以使肿大的甲状腺变小，使抗体滴度下降，停药后可再复发而且药物有潜在不良反应，故不推荐使用。
预后
大多预后良好，自然发展为甲减趋势(76%)，以往认为是永久的，但部分有替代后甲功自发恢复的情况。有些肿大的甲状腺或结节可缩小或消失，由质韧变软;本病有发展为淋巴瘤危险，甲状腺癌发生率高于对照人群。
二、亚急性肉芽肿性甲状腺炎
治疗主要从两方面进行：对症处理和针对甲功异常处理。症状较轻的患者不需要特殊处理，仅使用非甾体抗炎药就可缓解，一般服药2周左右。对于全身症状较重、持续高热、疼痛明显的患者可酌情使用糖皮质激素，首选强的松20-40mg/日，24小时症状可缓解，1-2周后开始减量，据ESR指导用药，过快减药易 加重病情，疗程1-2月，但部分患者减停药困难或复发。
对于甲状腺功能亢进不需要抗甲状腺药物和碘放疗，常用B阻滞剂心得安对症。出现甲状腺功能减退时，一过性时不一定非要用甲状腺激素替代，若有临床甲减症状可临时替代，但当发生永久性甲减时需甲状腺激素终身替代。
预防与预后
预后良好，病程有自限性，但可复发。增强抵抗力，避免上呼吸道感染和咽炎有助于预防本病发生。甲功恢复后，滤泡储存碘功能恢复在临床完全缓解后1年以上，永久甲减发生率<10%。
三、亚急性淋巴细胞性甲状腺炎
本病治疗为对症处理。甲亢症状不明显无需特殊处理，症状显著者可口服B受体阻断剂，不需要使用抗甲状腺药物，手术和同位素治疗为禁忌。甲减期为一过性轻型无需处理，持续性或加重者可采用甲状腺激素替代。