跖疣的治疗一般采用外治法为主，如皮疹数量较多者，可结合辨证治疗。主要的治疗方法是养血平肝、活血通络。目前的治疗方法包括全身治疗、局部药物治疗、物理治疗和针灸治疗等。
一、跖疣的西医治疗
1.全身治疗
(1)干扰素。
(2)治疗疫苗。
2.局部药物治疗
多数疣患者在发病后1～2年内能自行消退，因此对疣的各种局部治疗的疗效评价应特别慎重，对一些能造成永久性瘢痕的疗法不宜使用。
局部疗法与寻常疣相同。对顽固难治者可用0.1%争光霉素生理盐水或2.5%氟尿癌啶加2%普鲁卡因(二者为5：1)混合液0.5mL注射损害中心，每周1次，连用2—3次，如表面胼胝样角质层厚者，应先用20%水杨酸火棉胶或软膏除去后再注射，或用液氮冷冻或二氧化碳激光。
对镶嵌疣可用10%福尔马林溶液外擦，每天2次。每次15—30min，连续数周。或10%冰醋酸液浸泡，每日1次。孤立顽固损害可放射治疗，每次5Gy，每周2次，总量可达30Gy。最近国外报道，20%戊二醛溶液外用，每日1次，疗程12~24周，治疗难治性跖疣，有良效。
3.物理治疗
冷冻疗法、电灼疗法、激光治疗、红外凝固治疗适用于数目少的跖疣。
4.针灸治疗
火针治疗跖疣简单易行，见效较快，有一定治愈率。
二、跖疣的中医治疗方法
跖疣多因风邪搏于肌肤，或因怒动肝火，肝旺血燥，筋脉不荣，以致气血凝滞，加之足底部受压及摩擦，而发生皮疹。
1.中医中药
以养血平肝、活血通络、调和气血，活血解毒，软坚为治疗法则。
(1)外治法
①千金散局部外敷;②乌梅肉置盐水中浸泡一昼夜，捣为泥状，每次少许敷患处;③木贼、香附、板蓝根、乌梅、威灵仙、大青叶，煎水浸泡患部。每日1剂，可复渣再煎，每剂浸泡2～3次，每次30分钟。
建议：点涂疣体，再用胶布封包。跖疣是由人体病毒感染引起的，不建议使用创伤性的治疗方法。
(2)内服法
桃仁10克，红花10克，当归30克，熟地黄20克，川芎10克，赤芍30克，炮山甲15克，夏枯草15克，板蓝根30克，制首乌30克，白术15克，甘草10克。上药加水煎煮2次，药液对匀后分2次服，每日1剂。
2.单验方
1.30%生半夏霜外搽。
2.生半夏粉加白糖少许，外敷，胶布贴封，3天一换。
3.紫硇砂30克，研粉外包，每周一换。