黑色素瘤复发和转移率均较高，预后差。影响预后的因素包括。
1、与肿瘤浸润深度有关
根据世界卫生组织对一组恶性黑色素随访的结果，预后与肿瘤厚度有密切关系。肿瘤≤0.75mm 者，5 年生存率为89%，≥4mm者仅25%。
2、淋巴结转移情况
无淋巴结转移者5 年生存率为77%，而有淋巴结转移者仅31%。生存率还与淋巴结转移的多少有关。
3、病灶部位
恶性黑色素瘤的发生部位与预后有关。发生于躯干者预后最差，5 年生存率为41%;位于头部者次之，5 年生存率为53%;四肢者则较好，下肢者5 年生存率为57%，上肢者60%;发生于黏膜的黑色素瘤预后则更差。
4、年龄与性别
一般认为女性病人明显好于男性，年龄轻者比年老者为好。
5、手术方式
即肿瘤厚度与切除范围有关，厚度≤0.75mm，切除范围距肿瘤边缘2～3cm;>4mm 者距离肿瘤边缘5cm 范围的广泛切除。不符合规格的区域淋巴结清除术，常会促进肿瘤向全身播散，影响预后。