根据病变形态的多形性，弥漫性，分布对称，渗出发痒，病变界限不清楚，病程长，反复发作等特点，即可诊断，但应与下列疾病相鉴别。
肛周湿疹与肛门瘙痒症的鉴别：
湿疹常发有丘疹、红斑、渗出、糜烂，以后继发瘙痒，而后者常以发痒为主，无渗出液，搔抓破后，继发渗出、出血、糜烂。
肛周湿疹与接触性皮炎的鉴别：后者有明显的接触物刺激病史，容易查清，皮疹仅限于接触部位，形态单一，水疱大，境界清楚，去除病因后，皮炎消退较快，很少复发。
肛周湿疹与肛周神经性皮炎的鉴别：后者常发瘙痒，后出现扁平丘疹，有苔癣样变，淡褐色，干燥而坚实，病变部位可延至骶尾部、会阴及阴囊。