用于立克次体病诊断的方法虽有多种，但最常用者仍为外斐试验。宜取双份或三份血清标本(初入院、第2周和恢复期)滴定效价在1∶160以上者为阳性，有4倍以上增长者则更具诊断意义。次常用者为补结试验和微量凝集试验，其它如IFA、ELISA、固相放射免疫测定(SPRIA)、乳胶凝集试验、间接血凝试验、免疫电镜等也有助于诊断，但临床上应用较少或仅供研究、流行病学调查等之用。
病原体的分离可采用鸡胚培养、组织培养，或豚鼠、小鼠、大鼠等动物接种。战壕热的病原体可在以血琼脂为基础的培养基上生长，除战壕热病原体和其它巴通体之外，其它人类立克次体病病原体的初代分离均采用豚鼠或(和)小鼠接种。由于病人血中立克次体很少，接种和组织培养等方法往往失败，且易导致实验室传播，不宜推广。
早期有效的治疗可使抗体产生延迟1周左右，因而必须在发病后4～6周重复血清学检查1次。