1、粪便检查
粪便检查包括便常规、便培养、虫卵。粪便查便粪便性状呈糊状、稀便或水样，量多或具恶臭，粪便中不含黏液、脓血或仅含脂肪时，常提示为小肠性腹泻或肝、胆、胰腺功能低下性腹泻;如粪便量少，含黏液、脓血时则多提示为结肠性腹泻;粪便中发现原虫、寄生虫或虫卵，又能排除其他原因时，可提示为原虫、寄生虫性腹泻;粪便培养可分离出多种致病菌，对诊断有重要价值。
2、胰腺外分泌功能试验
如怀疑腹泻是胰腺疾病所致时，应进行胰腺外分泌功能试验，如试餐试验(Lundh试验)、苯甲酰-酪氨酸-对氨基苯甲酸试验(PABA试验)及促胰泌素试验等。
3、小肠吸收功能试验
粪便中脂肪球、氮含量、肌纤维和糜蛋白酶含量测定
显微镜高倍视野下，脂肪球高达100个以上时(苏丹Ⅲ染色法)，可考虑脂肪吸收不良;粪便中含氮量增加时，考虑系糖类吸收不良;粪便中肌纤维增多，糜蛋白酶含量降低时，都提示小肠吸收不良。
右旋木糖试验
小肠吸收功能不良者，尿中D-木糖排出量常减少。放射性核素标记维生素B12吸收试验(Schilling试验)：小肠吸收功能障碍者，尿内放射性核素含量显著低于正常。
4、呼气试验
多为14C-三酰甘油呼气试验。脂肪吸收不良者口服14C标记的三酰甘油后，由肺内呼出的14C标记的CO2减少，而粪中14C标记的CO2排出量增多。近年来开展较多的13C呼气试验可观察糖类的吸收情况，对乳糖吸收不良亦有重要的诊断价值。此外还有14C甘氨酸呼气试验等方法。