总体来说，肛周脓肿的病因方面比较复杂，多数情况下都是感染因素所引起，但其他方面也有致病因素，当然，针对一种疾病的预防，最为基础的方面就是及时掌握疾病的相关知识。比如病因方面等。下面，就肛周脓肿的预防方式进行介绍：
1.积极防治其他肛肠疾病，如肛窦炎、肛乳头肥大、肛裂、炎性痔、直肠炎等能及时、正确、有效的治疗，可以避免和减少肛周感染，脓肿和肛瘘的发生。
2.防治便秘和腹泻，对预防肛门直肠周围感染有重要意义，它能避免和减少肛门直肠区的粘膜和上皮组织的损伤或炎症，可降低脓肿与肛瘘的发病率。
3.一旦发生肛门直肠周围感染，应及早到正规的医院诊治，并采用有效的抗感染措施，包括全身及局部的治疗，可防止炎症蔓延、扩散，切勿轻信游医成所谓“祖传”的宣传而延误诊断及治疗。
4.保持肛门部清洁卫生，勤换内裤，坚持每日便后清洗肛门，对预防感染有积极作用。避免腹泻与大便干燥，刺激肛隐窝发炎诱发肛周脓肿，因而防治便秘和腹泻对预防肛周脓肿形成具有重要意义。
5. 便秘会让肛门充血和干燥大便摩擦肛门。有的人则是因为怕肛门不干净，反复擦拭肛门，部分患者因为肛门括约肌薄弱、肛管短，在擦拭过程中易使肛门黏膜外翻，肛窦暴露在肛门外，同时受到机械刺激，使之充血、水肿，进而感染发炎，形成肛窦炎，肛窦炎可发展成肛门脓肿。所以在便完后，应用温水洗浴肛门，用柔软、干净的旧毛巾，沾去肛门周围皮肤的水珠，而不是去擦肛门，更不应该使用粗硬的劣制卫生纸用力去擦肛门。
6.及时治疗可引起肛门直肠周围脓肿的全身性疾病，如溃疡性结肠炎、肠结核、克隆氏病等。
7. 少吃辛辣刺激性食品，特别是夏季，冷饮生食常常引起腹泻从而导致脓肿的发生，平时锻炼身体，增强体质，久坐久站的人肛门局部血液循环易发生障碍，降低了局部的抗病能力，容易发生感染。所以，久坐之人要积极参加体育运动，增加肛门部的抗病能力。不要久坐湿地，在草地、湿土上久坐，肛门部受凉受湿，降低了抗病能力，寒湿之邪容易侵入肛门，引起感染。