灰指甲是一种较顽固、难治愈的真菌感染性疾病，经常是应用各种治疗方法，治疗了很长时间却没有治愈或治愈后复发。其实，只要坚持正确的治疗方法，灰指甲是可以根除的，对于有些病情较重的患者需要联合多种方法，持之以恒地治疗才能治愈。单用一种传统方法治疗，由于每种方法都存在缺陷，可能会导致疾病长期不能治愈，或治愈后又出现再发、复发。
外用碘酊或冰醋酸溶液涂抹患甲治疗灰指甲，需要坚持一年以上才会起到明显效果。患者经常会因为不能坚持或接受不了碘的颜色或冰醋酸的气味而中途放弃治疗。许多患者甲板增厚明显，较致密，外用碘酊或冰醋酸不能有效渗入至甲床，起不到治疗的作用。
口服抗真菌药物是一种治疗灰指甲有效的方法，但由于指甲是人体的最末端，口服药物的有效成份到达感染部位的有效浓度很少，需要长期坚持服药。药物疗程较长加之药物不良反应较多，常会导致患者结束治疗，功亏一篑。
手术拔甲也是一种传统的治疗方法，曾一度被公认为铲除灰指甲的好方法。但实际上拔甲术并不能彻底铲除已经存在于甲床组织上的真菌，治疗效果常不确定，而且这种方法创面大，出血多，疼痛，易引起感染，不易被患者接受。