1、微生物感染(10%)
各种病原微生物的感染，如病毒、细菌、寄生虫、原虫等，其中以肝炎病毒最为重要。药物和毒物的损害，由于人类接触化学物质和药物的机会越来越多，故药物性和中毒性疾病也相应增加。
2、代谢异常(5%)
代谢异常，由于肝脏是物质代谢的中心，任何一种物质代谢都与肝脏密切相关，如胆色素代谢异常可致黄疸、脂肪代谢异常可致脂肪肝、铜代谢异常引起豆状核变性等。
3、环境因素(70%)
目前认为肝脏疾病中约70%是由病毒、化学物质、酒精(或营养不良)三大环境因素所致。
4、遗传(15%)
约15%是与代谢或其他先天异常的遗传因素有关。
5、病理改变归纳为六个方面
①肝细胞变性坏死导致细胞形态和功能的异常。
②胆汁淤滞，既可由肝细胞破坏分泌胆汁的功能障碍，也可由胆道梗阻所致，病理上主要表现为肝细胞内和胆管系统内胆色素沉着和胆栓形成。
③肝实质内炎性反应，表现为汇管区为主的炎细胞浸润、库普弗氏细胞增生以及肉芽肿形成等。
④间质纤维组织增生，尤其是慢性肝炎时，以汇管区为中心肝间质纤维组织增生，可互相延伸、连接。原有肝小叶破坏、分隔、改建，逐步发展为肝硬变，导致临床上出现门脉高压症。
⑤肝占位性病变，主要见于肝肿瘤和肝脓肿，病变占据肝实质的一部分，并压迫周围的正常组织。
⑥肝血管系统损害，如肝硬变造成肝血流量减少和门静脉高压症。此外尚有肝静脉阻塞(巴德-基亚里二氏综合征)和肝动脉梗塞等。